ülkenin büyük çoğunluğu şiidir. fakat kuzey ve kuzeybatı taraflarında sünniler de var. örn: şeki-zakatala bölgesi, guba-haçmaz bölgesi. ayrıca şunu da belirtmek isterim ki, azerbaycan dünyada mezhepsel kutuplaşmanın en düşük olduğu ülkelerden biridir. azerbaycanlılar günlük hayatta mezhep farkını bir ayrım unsuru olarak görmezler.