Katoliklik ve Mesih’in görüşlerine aykırı olmak, Teslis inancını reddetmek, Meryem’in bakire olup olmadığını sorgulamak, cehennemin varlığını reddetmek ve çoklu evrenin varlığına inanmakla suçlanan Bruno 7 yıl yargılandı. Duruşma sırasında çizgisini bozmayarak tüm düşüncelerini aynı şekilde muhafaza ettiğini söyleyen Bruno’yu Papa VIII. Clement dalalet ile suçlayıp idam etti. 17 Şubat 1600 tarihinde saçları traş edilip dili küçük bir tahta parçasına çivi ile sabitlenerek başı asıldı ve çıplak bir şekilde diri diri yakıldı.