5 Ağustos 2013'te istanbul 13. Ağır Ceza Mahkemesi tarafından karara bağlanan Ergenekon davasında 10 yıl 6 ay hapis cezasına çarptırıldı. Hüküm Yargıtay'da kesinleşmemiş olmasına rağmen tutuklanan Yanardağ, 10 Mart 2014 tarihinde mahkeme kararıyla tahliye edildi.
