bazı kaynaklarda yüzüyle ilgili bir hastalığının bulunduğu, ölümünden sonra eski dine dönülürken mısırlı din adamlarının bu durumu propaganda amacıyla, lanetlenmiş firavun gibisinden, kullandığı belirtilmektedir. gerçekleştirdiği din devrimi nedeniyle ülke dışarıyla ilgilenememiş bunun sonucunda diğer devletler ortadoğu bölgesinde kolayca hakimiyet sağlamıştır. aynı zamanda akhenaton'un üçüncü kızı Anhesenamen, evlenmek ve bu sayede mısır tahtına geçmesi için hitit kralı Şuppiluliuma'dan bir oğlunu göndermesini istemiştir. hitit kralı oğlu zananza'yı gönderir fakat yolda öldürülür.
