Said-i Nursi;nin düşünce yapısı da islam inanışı ile çoğu yerde çelişki gösterir. Ve bu çelişkiler islam alimi olmayanlar tarafından bile hemen anlaşılacak şekilde çok açıktır. Hiç evlenmemesi, Cuma namazına gitmemesi, kendisine Kuran öğreten hocalarına karşı gösterdiği saygısızlık gibi. Ne Yunus Emre ne de diğer islam büyükleri kendilerini yetiştiren hocalarına karşı ''Sen bir şey bilmiyorsun'' lafını kullanmamıştır. Belki de bundan dolayı Said-i Nursi ders almak üzere gittiği tüm medreselerden kovulmuştur. Cuma namazı kalabalık olarak kılındığından ve kendisinin kalabalık yerlerde namaz kılmaktan huzur bulmadığını söyleyen Said in durumu son derece ilginçtir. Çünkü Cuma namazı inananlar için müminlerin bir araya toplandığı bir andır ve cemaat ile kılınması zorunludur. Üst üste üç Cuma namazı kılmayan bir Müslümanın cenaze namazı bile kılınmaz.
Risaleleri ile ilgili söylediği sözler bile islamı nasıl yorumladığını bizlere gösterir.Risale-i Nur okumak ona hizmet etmek bir ibadettir. Ona hizmet üç aylarda yapılan zikirlere bile tercih edilmelidir. Kısacası Said-i Nursi kendi yazdığı kitapları okumanın Allah a karşı yapılan ibadetten daha hayırlı olduğunu söyler ve islam a yeni bir yorum getirir.
Bu noktada akla ingiliz casus Hempher in anıları geliyor. Az sayıdaki ingiliz casusa verilen islam ı Nasıl Yıkarız adlı kitapta da cihadın geçici bir farz olduğu ve artık cihad yerine başka işlerle uğraşmasının Müslümanlar için daha iyi olduğu propagandasının yayılarak islamiyetin zayıf düşürülmesi öneriliyordu. Kurtuluş Savaşı sırasında da ikdam gazetesinde Kuvayı Milliyecilerin ingilizlere karşı savaşmaması için bildiri yayınlayan Said-i Nursi nin davranışının bir nedeni de bu olabilir mi?
Said-i Nursi, ''Risale-i Nur okumak ya da yazmak alim olmak için yeterlidir. Başka şey istemez''. sözü ile Kuran ı, hadisleri ve diğer tüm islam bilimlerini bir çırpıda silmiş temel kaynak olarak kendi risalelerini koymuştur. Hattâ Hizbullahın öldürdüğü Zehra Vakfı nın bir üyesinin cenazesinde de Kuran yerine risale okuyacak kadar ileri gitmişlerdir.
Bu ve bunun gibi islamdışı yorumlarından dolayı nurcular, diğer bazı tarikatlar tarafından 'narcılar' yani cehennemlikler diye adlandırılmaktadır.
