Genel sağlık sorunları ve hastalıkları da kötü ağız kokusuna neden olmaktadır. Sinüs enfeksiyonları, burun akıntısı, geniz akıntısı ve ağız kokusuna neden olabilir. Böbrek yetmezliği olan kişilerde idrar gibi kokan ağız kokusu olabilir. Karaciğer yetmezliğinde balık gibi ağız kokusu olabilir. Kronik reflü, mide sorunları, kötü bir nefese neden olabilir. Diyabet (şeker hastalarında) hastalarında, kontrolsüz diyabetin neden olduğu, diyabetik ketoasidoz tablosunda nefes meyveli bir kokuya sahip olabilir.
