1481'de yeni bir sefere çıkacaktı. çok önemli ve büyük bir sefer olacaktı. üsküdar'ı geçip, malta ile gebze arasındaki çayırlığa otağını kurduran padişaha hususi doktoru yakup paşa bir bardak şerbet sundu. Fatih Sultan Mehmet şerbeti içtikten birkaç gün sonra rahatsızlandı. tedavisi için yine aynı doktor tesiri her gün biraz daha fazlalaşan zehiri ilaç olarak sundu. Nitekim 3 Mayıs 1481'de iyice rahatsızlaşarak son nefesini vermiştir.
islam alemi yasa boğulurken, hristiyan ve yahudi dünyası sevinçle çalkalandı. papa, bütün avrupa kiliselerine üç gün üç gece çanlar çalarak bu haberin kutlanmasını emretti. "büyük kartal öldü" diyerek adeta bayram havası estirdiler. suikaste uğradığı anlaşılınca venedikli bir yahudi olup asıl ismi maestro lacopo olan yakup paşa öldürüldü.
tarihteki en yüce şahsiyetlerden biri, gerçek bir ilim adamı, üstün ve zeki bir komutan, şerefli ve asil bir müslümandı.
