kendisinin görev süresinin dolmasına mütakip cemaat tarafından ergenekon davası başlatılmış ardından TSK ve yargı içerisindeki laik, kemalist asker ve yargıçlara operasyon başlatılmıştır. Çünkü Ahmet Necdet Sezer böyle cemaat gibi haysiyetsiz örgütlere hiç göz açtırmıyordu.