ölümünden sonra oğulları cem sultan ile 2. bayezid'ın giriştikleri taht mücadelesi nedeniyle naaşı topkapı sarayında unutulmuş osmanlı imparatoru, kayzer-i rum'dur. 2. beyazid tahta geçtikten sonra -ölümünden 15 gün sonra- fatih'in kendi yaptırdığı ismini taşıyan fatih cami'sine 2.bayezid'in ve devlet erkanın omuzlarında getirilmiş(bu açıdan son örnek), mihrabın önüne defnedilmiştir.