2000-2001 sezonu, takımın başında yeni göreve başlayan mustafa denizli, ligin 5. haftası beşiktaş karşısında alınan 3-0 hükmen mağlubiyet, sahadaki yabancı sayısı rezaleti, fenerbahçe'nin o sezonki 5 maçta 2. yenilgisi, taraftar ve tüm kamuoyu mustafa denizli'yi istifaya çağırıyor, 5 yıl aradan sonra sezon sonu şampiyon fenerbahçe.
2003-2004 sezonu, takımın başında yeni göreve başlayan daum, ligin daha ilk haftası kadıköy'de istanbulspor'a karşı alınan 3-0 mağlubiyet ve ligin ilk yarısında liderin 7 puan gerisinde 2. sıra sonrası hem daum hem yönetim istifaya çağrılıyor, sezon sonu ve ertesi sezon şampiyon fenerbahçe.
2006-2007 sezonu, 100. yılda takımın başında yeni göreve başlayan zico, şampiyonlar ligi ön elemesinde dinamo kiev'e eleniş ve ligin 8. haftasında kadıköy'de alınan bursaspor mağlubiyeti sonrası tribünler zico istifa diye inliyor, sezon sonu şampiyon fenerbahçe, ertesi sezon cl çeyrek final.
2010-2011 sezonu, takımın başında göreve yeni başlayan aykut kocaman, sezon başında avrupa kupalarında üstüste young boys ve paok'a eleniş, sezon ortasında yeni malatyaspor karşısında kupada alınan mağlubiyet, aykut kocaman'a istifa çağrısı bir yana bir de çuvalla hakaret, sezon sonu şampiyon fenerbahçe, ertesi sezonlarda gelen 2 türkiye kupası ve uefa avrupa ligi'nde yarı final.
2013-2014 sezonu, takımın başında yeni göreve başlayan ersun yanal, diğer tarafta geçmişten hiç ders almayan fenerbahçe taraftarı.
