--spoiler--
Babasının 1942 yılında ölümü genç Erbakanı derinden yaralar ve manevi dünyaya yönelişi bu dönemde başlar. 1943 yılında istanbul Erkek Lisesinden yine dereceyle mezun olan Erbakan, girdiği sınavları başarıyla geçerek iTÜ makine mühendisliği bölümüne girer. Erbakan sınavlarda gösterdiği üstün başarı nedeniyle üniversiteye 2. sınıftan başlatılmıştır. ilkokula 6 yaşında, üniversiteye de ikinci sınıftan başlaması dolayısıyla kendisinden iki yaş büyük olanlarla aynı sınıfta öğrenim gören Erbakanın sınıf arkadaşlarından biri de Süleyman Demireldir. Demirel-Erbakan ikilisi arasındaki rekabetin bu dönemde başladığı rivayet edilir. Üniversite yıllarında okula mescit açılmasına öncülük eden Erbakan, çeşitli tarikatlarla da ilk bağlarını aynı Demirel gibi iTÜde kurmuştur. iTÜde yaptığı yüksek ortalamayla gerçek bir okul efsanesi haline gelen genç ve zeki Erbakan iTÜyü bitirdikten sonra 1948-1969 yılları arasında 21 yıl sürecek bir akademik kariyer yapacaktır.
1948-1951 yılları arasında yüksek lisansını iTÜ Makinede yapan ve aynı bölümde asistan olarak çalışan Erbakan, doktora için Almanyada Aachen Teknik Üniversitesinden kabul alır ve Almanyaya gider. Alman Ordusu için araştırmalar yapan ve Aachen Teknik Üniversitesinde doktorasını veren Erbakan, 1953te Doçentlik sınavını vermek üzere istanbula döndü. 27 yaşında 1954te iTÜde Doçent oldu ve aynı üniversitede öğretim görevlisi olarak çalışmaya başladı. Araştırmalar yapmak üzere zaman zaman yine Almanyaya giden Erbakan, özellikle Leopar tanklarını geliştirme projelerinde gösterdiği başarılı performansla adından söz ettirmiştir. Mayıs 1954-1955 arasında askerlik görevini tamamlayan Erbakan, tekrar iTÜye döndü ve akademik kariyerine devam etti. 1956-1963 arasında 200 ortaklı ilk yerli motoru üretecek olan Gümüş Motoru kurdu ve Motor üretimini gerçekleştirdi. O dönemin Başbakanı Adnan Menderes de fabrikayı gezecek ve başarılı mühendis Erbakanı övecektir. Başarılı çalışmaları neticesinde 1965te Profesör unvanını alan Erbakan, 1967de ise muhafazakar söylemiyle Anadolulu iş adamlarının desteğini arkasına alarak Türkiye Odalar ve Borsalar Birliği (TOBB) Genel Sekreterliğine seçildi.
--spoiler--