ergenekon terör örgütünün kilit isimlerinden olduğu iddia edilen, tuncay güneyin bir açıklamasında; harun yahya için, '' finansmanı israil tarafından sağlanmaktadır '' şeklinde bir iddiası olmuştur.
bu iddianin paralel zamanlarında, daha evvelden boy boy reklam verdikleri islami kesimin gazetelerinde de reklamları yayınlanmaz olmuştur.