1. Nuc. tractus mesencephalici n. trigeminalis: Yüzden gelen proprioseptif duyuyu alır.
2. Nucleus nervi trochlearis
3. Nucleus nervi oculomotorii Nucleus accessorius
4. nervi occulomotori fautono-micus veya Edinger VVestphal).
5. Substantia niara: ekstrapiramidal sistem çekirdeğidir.
6. Substantia arisea centralis (periagueductal gri cevher): Agueductus çevresindedir. Endorfin üretir.
7. Formatio reticularis çekirdekleri
8. Nuc. ruber: Tegmentum içindedir. Ekstrapiramidal sistemin önemli bir çekirdektir.
9. Nuc. interpeduncularis
10. Colliculus superior: Görme refleksleri merkezidir. Görme sonucu oluşan göz, baş ve boyunun refleks hareketler ile ilgilidir.
11. Colliculus inferior: işitme refleksleri merkezidir. Sese bağlı olarak baş ve boynun refleks hareketleri ile ilgilidir.
12. Nuc. pretectalis: Pupilla refleksi ile ilgilidir.
13. Nuc. interstisialis
