Kanalizasyon sularında çok sayıda kimyasal madde bulunuyor.Bunlardan bir bölümü temizlik malzemelerinden kaynaklanıyor.Ancak,kanalizasyon sularında dolaşan kimyasalların önemli bir bölümünün kaynağı,insanlar ve hayvanlar için kullanılan ilaçlar ve kozmetik ürünleridir.Bir çok yerde kanalizasyon sularının denizlere,akarsulara ve göllere döküldüğü bir gerçek.Bu sulardaki kimyasal maddeler (özellikle antibiyotikler) canlılara zarar vermektedir.