Karşıyaka Lisesi, Karşıyaka Ortaokulu bünyesinde 1945 yılında kurulmuştur. 1946 yılında Karşıyaka Kız Muallim Mektebi'nin kapatılmasından sonra Karşıyaka Lisesi, günümüzde eğitim-öğretimine devam ettiği Alaybey'deki binalara taşınmıştır. Bu gelişmeden sonra Karşıyaka Lisesi'nde öğrenim görmek isteyen öğrenci sayısında büyük bir artış olmuş ve bu olgu zamanla binaların yetersizliğine yol açmıştır. 1979 yılında bina yenilenmiş ve aynı yıl karma eğitime geçilerek okul daha çağdaş bir yapıya kavuşmuştur. Okul, 2005 yılında iZSU öncüşüğünde kapsamlı bir restorasyondan geçmiş ve binası son halini almıştır. Aynı yıl statü değiştirerek Anadolu lisesi olmuş ve "Karşıyaka Merkez Anadolu Lisesi" ismini almıştır fakat eski mezunlardan gelen yoğun istek üzerine okulun ismi 2007 yılında tekrar "Karşıyaka Lisesi" olmuştur.
