1874 yılında yarı arap aygırı ile Tyrol kısrağının melezlenmesinden doğmuştur. 2. dünya savaşı boyunca yük atlarına olan ihtiyaç dolayısıyla Haflinger atlarında önemli değişiklikler yapılmıştır. Savaş sonunda ise türün boyuna ve saflığına geri dönülmüştür.