bazen Genç Pompey olarak çağırılır (zaman zaman Cneius, Gneius olarak telaffuz edilir), Cumhuriyetin son dönemlerinde yaşamış olan Romalı politikacı ve general.
Gnaeus Pompeius, Büyük Pompey'in üçüncü karısı Mucia Tertia'dan olan oğludur. Hem Gnaeus Pompeius hem de kardeşi Sextus Pompeius Roma tarihinin en büyük generallerinden biri olan babalarının gölgesinde büyümüşlerdir. Sezar'ın MÖ 49 yılında Rubicon nehrini geçmesi sonucu ortaya çakan iç savaşta Gnaeus, pek çok senatör gibi, doğuya kaçan babasını takip etti. Pompey'in ordusu MÖ 48 yılında Farsalus savaşı'nı kaybedince Pompey hayatını kurtarmak için kaçmak zorunda kaldıysa da aynı yılın 29 Eylül'ünde Mısır'da yakalandı ve öldürüldü.
Babalarının ölümünün ardından Gnaeus kardeşi Sextus'la birlikte Afrika eyaletinde ortaya çıkan Sezar muhalifi harekete katıldı. Metellus Scipio, Genç Cato ve diğer senetörlerle birlikte Sezar'ı ve ordusunu ortadan kaldırmak için hazırlıklara başladılar. Sezar, kısa bir süre sonra suikast sonucu öldürülecek olan Metellus Scipio ve Cato'yu MÖ 46 yılında yapılan Thapsus savaşında bozguna uğrattı. Gnaeus bir kez daha kaçmak zorunda kaldı ve Balear Adalarına giderek kardeşi Sextus'a katıldı. Sezar'ın eski generallerinden Titus Labienus ile birlikte yeni bir ordu toplamak için Hispanya'ya geçtiler.