Bandırmaspor, 1965 yılında bordo-beyaz renklerle kurulmuştur. 1965-66 sezonunda 2.ligde mücadeleye başladı. 1973-74 sezonunda 3.lige düştü. 1974-75'de yeniden 2.lige yükseldi. 1986-87 sezonunda yeniden 3. lige düşen kulüp, 1988-89 sezonunda son kez 2. lige çıktı. Uzun yıllar 2.ligde oynayan Bandırmaspor son olarak 1992-93 sezonunda 3.lige, 2004-05 sezonunda da amatör kümeye düştü. Bandırmaspor 2007-2008 sezonunda Balıkesir Süper Amatör Ligi'nden tekrar 3. lige yükseldi.iki sene TFF 3.Ligde mücadele eden Bandırmaspor 2009-2010 sezonunda yeniden TFF 2.Lige yükselmiştir ve 2010-2011 sezonunda Bank Asya 1. Lige yükselmek için mücadele edecektir.
