gerek iran - ırak savaşı'nın gerekse iran devrimi'nin türkiye üzerinde önemli etkileri olmuştur. yeni kurulan teokratik rejimden kaçan bir göçmen kitlesi, içindeki iran gizli servisi savama'nın ajanlarıyla birlikte türkiye'ye sığınmıştır. diğer bir sonuç da türkiye'nin tarihsel bağlamda sorunlarının bulunduğu köktendinci hareketlerin canlanmasıyla humeyni devrimi arasında kurulan ilişkidir. ancak iran rejiminin bu aktiviteleri desteklediği düşünülmekle birlikte, türk hükümeti özellikle iyi giden ticaret ilişkileri nedeniyle bu girişimleri gözardı etmiştir. kamuoyuna yaptığı açıklamalarda islamcı tehlikenin iran'dan gelmediğine yemin etmesine rağmen, başbakan turgut özal haziran 1987'de tahran'a yaptığı bir ziyaret esnasında iran ile bir anlaşma imzalamıştır. buna göre, iki ülke birbirlerinin içişlerine karışmayacak, devlet radyo ve televizyonlarında türkiye ve iran karşıtı yayınlar yapılmayacak, sınır güvenliği sağlanacak, iki ülkenin muhalifleri birbirlerinin ülkesinde aktivitelerine devam edemeyecekti.
...
bu bağlamda başbakan hüseyin musavi, ankara ile tahran arasındaki ilişkilerin düzelmesinin türkiye'nin müslüman inançlarına saygı göstermesiyle mümkün olabileceği ile ilgili açıklamalar yapmaktan, iranlı otoriteler de türklere karşı negatif bir tavır almaktan çekinmemişlerdir. ilerleyen yıllarda da iran, türkiye'yi rahatsız eden açıklamalarına devam etmiş, 1999'da tbmm'ye başörtüsüyle gelen merve kavakçı'ya açık destek verip, devlet politikalarını eleştirmeye devam etmiş, 2000li yıllarda türk hizbullah' ile tahran arasındaki ilişki gündeme oturmuştur.
