Kafatasının kaybolma nedeni aksiyon dergisinde şöyle yazmakta:
birinci dünya savaşından sonra dunyada ırkların kokeni ve yapıları hakkında araştırmalar hız kazanmıştı bu çalışmalar türkiye'de de yürütülmeye başlanmıştı 1928 yılından itibaren tarihci afet inanın yönlendirdiği bir ekibin türklerin beyaz ırka mensup brakisefal * , grekler * romalılar ile aynı ırktan geldiklerinin kanıtlanması için kafataslarının ölçülerek standart türk ırkının kafatası formülünü çıkarma projesinin uygulamaya koymuştu
cenevre üniversitesinden eugene pittardın danışman olarak görüşlerinin alındığı projeye uygulama aşamasında sadi irmak, dr. şevket aziz kansu, fuat köprülü, remzi oğuz arık da proje uygulamasına destek verdiler. ağustos 1935 tarihinde afet hanım ve bilim adamları ünlü mimar sinanın türbesine gelerek kafatasını çıkardılar
afet hanımın türk tarih kurumu asbaşkanı olarak yönlendirdiği kafataslarını ölçerek türk ırkının standart özelliklerini tesbit çalışmaları milli eğitim ve kültür bakanlıklarının da destekleriyle 1938 yılına kadar devam etti. antropoloji enstitüsü verilerine göre 64.ooo kafatası ölçüldü. ünlü türk şahsiyetlerinin seçilmiş kafataslarının sergilendiği bir müze kurulmak isteniyordu. çok sayıda kafatası -bu arada mimar sinanın kafatası da dahil müzede sergilenmek üzere koruma altında tutuldu. 194olı yıllarda antropoloji müzesinden kafataslarının sergilenmesi çalışması rafa kaldırıldı. bu arada anadolunun her yerinden türbelerden getirilmiş kafataslarının bunların içinde mimar sinan'ınkide dahil akibetlerinin ne oldugu hala bilinmemekte.
