1601 yılında Prag'taki bir davette cok tuvaleti gelmesine ragmen masayı kibarlığından dolayı terk etmemiş ve çok uzun süre tuvaletini tutmasından dolayı vefat etmiştir. Daha sonra saçından alınan örnekle yapılan araştırmaya göre Tycho Brahe ürin enfeksiyonu sebebiyle kendini iyileştirmek için cıva seviyesi yüksek bir ilaç kullandığı ve bu sebeple zehirlenip öldüğü ortaya çıkmıştır.
Kendisi şu anda Isvec'te bulunan Ven adasında bilimsel bir enstitü kurmuştur(avrupa'nin o dönemlerdeki en iyi ve ilk gözlem üzerine dayalı araştırma enstitüsüdür).Burada kuyruklu yıldızlar, gezegenler ve yıldızlar hakkında ölçüm ve arastırmalar yapmıştır.
