M. Ö. 5000 yıllara ait fosiller bakıldığında kafatasına aletler kullanılarak cerrahi müdahale yapıldığı görülmektedir. Bu yönteme trepanasyon deniliyor.
Psikiyatrik hastalıkların(özellikle şizofreni, epilepsi vb.)nedenlerinin bilinmediği dönemlerde beyni ruhani ve doğaüstü güçlerin ele geçirildiği en inanılıyor. Ve kafatasına trepanasyon yapılarak ruhların beyinden uzaklaştırıldığı inancı var.
Günümüzdeki cerrahi müdahale şekli trepanasyonun modern hali..(Kraniyotomi)
Psikoaktif ilaçların kullanılmaya başlanılmasıyla 1950' lerden sonra bu tür işlemler azalıyor.
Beyni çok ciddi lezyon ya da tümör sarmışsa temizleme işlemi yapılıyor.
