Ülseratif kolit, iltihaplı kolon gibi hastalıklardan şikayetçi olan hastaların tedavisinde kullanılmaktadır. Dışkı nakli sayesinde gaita nakledilen hastanın sağlıklı bir bağırsak florasına kavuşması ve hastalığa neden olan mikroplardan kurtulması hedeflenmektedir.
