Beyköy zamanında bir beyin bulunduğu bir çiftlikmiş ve bey hastalandığında yanında çalışan tüm kahyalarına "artık beyiniz olmasın, herkes kendi evini kursun, burası bir köy olsun, adını da Beyköy koyun" diyerek vasiyet etmiş. Köyün adının daha önce Çubuklu Çiftliği olduğu bilinmektedir.
Edirne iline 134 km, Keşan ilçesine 24 km uzaklıktadır.
