Kara para aklama ile mücadele için, uluslararası kuruluşların baskısı sonucu 1997 yılında kurulmuştur. Kuruluş aşamasında iç işlerine mi Adalet Bakanlığına mı bağlı olsun diye tartışılmış. ihale Maliyeye kallmıştır.
ilk yıllarında sadece kara para aklama ile mücadele ederken, daha sonra görev tanımına terörün finansmanı ile mücadele de eklenmiştir.
Yurtdışında bu tür kuruluşlar "mali istihbarat birimi" (financial intelligence unit) olarak isimlendirilir.
Temel işlevleri kara para aklama ve terörün finansmanı ile mücadele kapsamında bilgi, veri, istihbarat toplayıp, bunları belli bir analizden geçirdikten sonra kolluk veya ilgili diğer birimlere iletmektir.