bu kilise bir moğol prensesi olan, bizans imparatoru Mihail Paleologos'un kızı prenses maria'nın adını taşır.
prenses maria, hülagü han'ın nişanlısıdır.
kendisi hülagü han ile evlenmek için yoldayken hülagü han vefat eder.
bunun üzerine de prenses maria, hülagü han'ın oğlu abhaka han ile evlendirilir.
lakin bu evlilik de uzun sürmez. abhaka han da kısa bir süre sonra vefat eder.
moğol töresine göre de han'ın eşi başka bir evlilik yapamayacağı için, prenses maria kalan hayatını bir azize olarak geçirir.
işte bu kilise de onun anısına yapılmıştır.
istanbul'un fethi sonrası pek çok kiliseyi camiye çeviren osmanlı, bu kiliseyi de camiye çevirmek istemiş.
ama kilisenin bir moğol prensesinin adını taşıdığı öğrenilince kiliseye dokunulmamıştır.