thomson atom modelinden sonra alfa ışıması deneyi ile artık atomun merkezinde,atomun neredeyse kütlesinin tamamını oluşturan,yoğun bir yapıda olan "cekirdek" kavramını ortaya koymuştur.ancak eksiklikleri ve aciklanamayan yerleri vardir.
mesela atomun kütlesinin hemen hemen yarisini olusturan nötronu açıklayamamıstır.
elektronlarin bulundugü yeri,hareketlerini acıklayamamıstır.ki bu büyük bir eksikliktir,bilim insanlari sırf bunun cevabini bulmak icin yeni modeller gelistirdiler.
ancak bilimin birikimli ilerlemesiyle birlikte Bohr atom modeline ve bugun kullandigimiz modern atom teorisine Rutherford atom modeli temel olmustur.
