filme göre matrix yaşadığımız hayattır. bir program yazılmıştır o program dahilinde bizim gördüğümüz her şey programın parçasıdır. ve insan tarlalarda yetişen bir varlık olarak ele alınmaktadır. programı yazan kişi -mimar- programı her güncellediğinde bir seçilmiş kişi oluşturur ve o kişinin matrix i anlayıp hacklemesini bekler. filmimizde de bu kişi yazılım şirketinde çalışan mr. anderson namı diğer neo'dur. matrix i anladığında çevresindekilerin inancıyla ve kendisinin seçilmiş kişi olduğuna inanmasıyla film kopar ve matrix reload ve matrix revolatuion devam filmiyle konu incelikle işlenir.
