Çağdaş burun ve sinüzit ameliyatları FESS (Fonksiyonel Endoskopik Sinüs Cerrahisi) yöntemi ile endoskop ve ince araçlar kullanılarak yapılır. Bu operasyonlarda burunun kaybettiği temel fonksiyonlar buruna yeniden kazandırılmaya ve burun olabildiğince normalleştirilmeye çalışılır. Tamamen burun içinden çalışıldığı için yüzde ya da burun dışında her hangi bir kesik ya da yaralanma oluşmaz.
Atardamar kaynaklı bir kanama (Hemaroji) olursa ameliyat yarım kalabilir ya da erken sonlandırılabilir. Bu ameliyatlarda cerrahın beceri yönü ön plana çıkar. Ameliyat, genel anestezi altında yapılır. Uzun da sürebilir. Bu operasyonlarla, polipler temizlenir, sinüsler temizlenir, maksiller sinüs kanalları genişletilerek bu sinüslerin daha iyi oksiijenlenmesi sağlanabilir. Etmoidal sinüsler, maksiller ve frontal sinüslere önceki doğallığı ve fonksiyonları yeniden kazandırılmaya çalışılır.
Genellikle ameliyat sona erdikten sonra 24 saat içinde hastaneden taburcu olunur.
Ameliyat sonrasında dokularda yapışmaların (sineşi) oluşmaması için pansuman ve kontrol dönemi başlar. Bu dönem aslında ameliyattan daha önemlidir. Bir kaç hafta boyunce bizzat ameliyatı yapan hekimin görmesi gereken kontroller ve tampon değişimi yapılır. Ancak bu tamponlar, insanlara sıkıntı ve acı veren, büyük tamponlar değildir. Çağdaş burun ameliyatlarında kullanılan, merocel adındaki küçük tamponlardır.
Ameliyattan sonraki ilk günde gözlerde yaşarma görülür, çünkü göz yaşı kanalı burun içine açılmaktadır, bu nedenle operasyondan etkilenir.
Ameliyat sonrasında yaklaşık bir yıl boyunca burun içi kortizonlu spreyleri kullanılır.