Aydın Adnan Menderes Üniversitesi rektörüdür.
2010 yılında yapılan seçimde mevcut rektör Prof. Dr. Şükrü Boylu 130 oyla ilk sırada, Prof. Dr. Sema Başak 122 oyla ikinci, Mustafa Birincioğlu ise 101 oyla üçüncü sırada yer aldı. YÖK listesinde ise ilk sıraya yerleştirilen Birincioğlu ise Abdullah Gül tarafından atanan isim oldu.
Seçimde MHP eğilimli öğretim üyelerinin desteğini aldığı belirtilen Mustafa Birincioğlu özellikle üniversite - sanayi işbirliği üzerinde duruyor. TGRT Haber'e verdiği bir röportajda Birincioğlu , bir işbirliğinden çok sanayi için eleman yetiştiren bir üniversite kurguluyor. "Jeotermal yatırımcılarıyla üniversitemizin niyetini kullandık. Biz size eleman yetiştirelim, teknisyen yetiştirelim, sizler için gezici laboratuvarlar oluşturalım. Sizin neye ihtiyacınız varsa biz üniversite olarak yanınızda olalım. Çünkü sizler bizim bölgemize milyonlarca dolar yatırım yapan insanlarsınız. Sizler bizim başımızın tacısınız. Biz sizin için ne yapabiliriz? Üniversite olarak bizim bakış açımız bu yönde." (Bilim ve Gelecek, Ekim 2012, Sayı 104)
