önce tüpe DNA'yı çoğaltacağımız sekansın problarını ve polimeraz enzimlerini koyarsın. ısıyı 92 dereceye çıkartıp DNA zincirlerini ayırırsın. ikinci aşamada 50 dereceye düşürüp probların baglanmasını sağlarsın. üçüncü aşamada 70 dereceye çıkarıp ısıya dayanıklı polimerazlarla iki zincirden de bir DNA çoğaltırsın. Bunu 20 30 kez yapinca milyonlarca DNA'n olur.