futbolculuk kariyerinde bir orta saha oyuncusu olan favre, 1976-1979 arası lausanne'da 30 maçta 3 gol, 1979-1981 arası neuchatel xamax'ta 51 maçta 14 gol, 1981-1983 arası servette'te 59 maçta 28 gol, 1983-1984 arası toulouse'da 35 maçta 7 gol, isviçre milli futbol takımı'nda ise 24 maçta 1 golle oynadı.
teknik direktörlük kariyerine 1991 yılında echallens'de başlayan favre, burada genç takımı ikinci lige çıkarma başarısı gösterdi. bu kulpten 1995 yılında ayrılan favre, daha sonra neuchatel xamax'ın akademi menajerliğine getirildi. favre burada profesyonel kulüplerin işleyişlerini öğrendi. 1997-2000 arası yverdon sports'u çalıştırdı. bu takımı küme düşmekten kurtarıp birinci lige çıkardı. 2000-2002 arası servette'i çalıştırdı. bu kulübü uefa kupası'nda iyi yerlere getirdi. 2003-2007 arası zürih'i çalıştırdı. burada 1 isviçre kupası 2 de şampiyonluk kazandı. 1 haziran 2007'de hertha berlin'in başına getirildi. bu kulübü 2008-2009 sezonu'nda ligin en fakir altıncı kulübü olmasına rağmen dördüncü yaptı. sonraki sezon fakirlik iyice dibe vurup yönetim de karışınca görevinden ayrıldı. asıl patlamayı 14 şubat 2011'de borussia mönchengladbach'da yaptı. bu takımı 22 maçta 16 puanlık bir rezaletten önce kümede bıraktı, bu sezon ise şampiyonlar ligi bileti kaptı. ligin en az gol yiyen ve en az yenilen* üçüncü takımı yaptı.
teknik direktörlük anlayışı olarak; genç oyuncuları takıma kazandırır, çabuk hücum eden ve savunmada yardımlaşan bir takım yaratır. düşük bütçeleri ve zayıf kadroları çok iyi işler.
futbolculuk kariyerinde 1985'te servette'le isviçre şampiyonluğu yaşadı, teknik direktörlük kariyerinde ise 2006 ve 2007'de isviçre'de, 2009'da ise almanya'da yılın teknik direktörü seçildi.
