Kendisi basit mikroskobu keşfetmiştir. ingilterede bulunan kraliyet derneği çalışmalarını çeviriyor ve böylece insanlar onun çalışmalarından haberdar oluyor ve bugüne kadar geliyor. Bitki tohumlarını, vertablalı küçük hayvanları incelemiştir. Ayrıca spermatozoa ve kırmızı kan hücrelerinin varlığını ilk defa Leeuwenhoek incelemiş. Hayvan histolojisinin kurucusu kabul ediliyor bu yüzden.
Kan dolaşımında kapiller keşfetmiş ve mikropsal alemi gözlemleyerek bunlara küçük hayvanlar manasına gelen animalküls adını vermiş.
Bu adam öldükten sonra bir süre kimse bir şey yapamamış çünkü mikroskop yapmak o zamanlar özel bir el becerisi istemekteymiş., 1820 lerde 19. yüzyıl sonlarına doğru birleşik mikroskoplar bulunmuş ve çalışmalara kalınan yerden devam edilmiş.