Ölümüyle ilgili bazı şüpheler vardır. Kurt Cobain'e yapılan otopsi sonucunda öldüğü sıralarda vücüdundaki eroin miktarı kendisini bir pompalı tüfekle vurmasına engeldir. Yani o kadar eroinle pompalı tüfeği kaldırması olanaksızdır. Ayrıca intihar mektubunda el yazısı bir süre sonra değişmektedir. Çoğu gazateci bu el yazının eşi Courtney Love'a ait olduğunu söylemektedir.
