Hastalığın alevlenme döneminde bağırsağın istirahati icin beslenme damardan yapılır. Lokal ya da sistemik Steroidler, 5-aminosalisilik asit, abse varsa metronidazol,bunların da yetersiz kaldığı durumlarda Azatiopürin, metotreksat gibi savunma sistemini baskılayıcı ilaçlarla tedavi edilmeye çalışılır.
