bu seferin osmanlı ya karşı yapılacağı haberini rusya önceden almıştır, ve osmanlı ya ittifak önermiştir. fakat osmanlı fransa dan böyle bir hareket beklememekte ve rusya ya da güvenmemekteydi. napolyon seferin hazırlıkları için toulusse limanında yeni bir donanma oluşturmaya başlamış ve gelen osmanlı elçisini de bu seferin ingiltere ye yapılacağını söyleyip kandırmıştı. osmanlı, napolyon iskenderiye limanına asker çıkarıncaya kadar rusya ile ittifaka gitmemiş, fransa ya inanmaya devam etmiştir. ondan sonradır ki tarihinide ilk defa rusya ile ittifak imzalamış ve ilk kez rus savaş gemilerinin boğazlardan geçmesine izin vermiştir. osmanlı ittifakının diğer üyeleri ise ingiltere (fransız donanması mısır a gelmeden bir kaç gemisini batırmış ve akka savaşında donanması napolyon un ordusunu denizden topa tutmuştur) ve iki sicilya krallığıdır. bu krallıklar da napolyon tehdidi altındaydı ve başlarında napolyon un fransa da yıktığı bourbon hanedanına ait krallar vardı. napolyon 38000 kişilik ordusu ile mısır seferine başlamıştı. ilk yenilgisini akka da aldı ve devamı da güney avrupa da geldi. ruslar la işbirliği sayesinde italya nın güneyinde birkaç ada osmanlı kontrolüne girmiştir.
